Por el avance de la gripe A, estas elecciones se tomaron medidas extraordinarias de prevención. Así, en las mesas de los comicios, es generalizado el uso del barbijo y el alcohol en gel por parte de las autoridades.
La ministra de Salud, Graciela Ocaña, recomendó que en los lugares con mayor nivel de infección, las filas de votantes se hagan al aire y libre. La funcionaria y varios especialistas en la materia aconsejaron que entre cada miembro de la fila se mantenga un metro de distancia para disminuir el contagio. Los especialistas también recomendaron el uso del barbijo a los votantes y pidieron no utilizar la saliva para cerrar el sobre electoral.
También se recomendó el lavado de manos antes y después de la votación. Al respecto, el Ministerio de Salud informó que a raíz de la epidemia se desinfectarían los sanitarios y mobiliarios de las escuelas asignadas para las elecciones.
